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模拟微重力对小鼠成纤维细胞miRNA表达的影响 |
宋向卫 王占宇 姜玉峰 徐冰心 司少艳 周金莲 杨鹤鸣 李成林 崔彦 |
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摘要 目的
探讨微重力环境对小鼠成纤维细胞应激损伤相关miRNA表达的影响。
方法
体外培养L929细胞,应用简单随机方法分为模拟微重力(SMG)组(SMG组)和正常重力(NG)对照组(NG组)。细胞培养7 d,提取样本总RNA行荧光标记和芯片杂交,采用Feature Extraction软件处理杂交图像提取原始数据,应用Genespring软件进行分位数标准化和后续处理,筛选差异表达显著的miRNA,qRT-PCR验证芯片结果准确性。通过miRNA靶基因预测数据库TargetScan和microRNAorg对差异miRNA进行靶基因预测,其交集作为潜在调节靶基因,对预测靶基因分别进行基因本体和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,判定差异miRNA主控的生物学过程和(或)信号通路。结合mRNA差异表达谱行miRNA-mRNA联合分析,并构建miRNA-mRNA功能网络和miRNA-mRNA调控网络。
结果
miRNA芯片检测发现,L929细胞在模拟微重力环境下较正常重力环境下差异表达的miRNA有21个,4个显著上调,包括mmu-miR-669j、-122-5p、-30a-3p和-6516-3p,其中mmu-miR-669j上调最为显著(52.84倍,P<0.05);17个显著下调,包括mmu-miR-21a-3p、-miR-28a-5p、-218-5p、-210-3p、-miR-19a-3p、-miR-31-3p -miR-19b-3p等,其中mmu-miR-28a-5p下调最为显著(15.47倍,P<0.05)。qRT-PCR结果与miRNA芯片结果一致(P<0.05)。靶基因预测和功能富集分析提示多种创伤修复相关生物学过程和信号通路显著富集(P<0.05)。通过miRNA-mRNA联合分析构建的miRNA-mRNA功能网络和miRNA-mRNA调控网络涵盖了所有具有显著差异的miRNA。
结论
微重力环境下小鼠成纤维细胞多种应激损伤相关miRNA表达发生显著变化,可能在微重力环境下创伤修复过程中发挥重要作用。基于芯片技术的miRNA靶基因预测和功能富集分析可为失重应激损伤机制探讨和创伤修复措施提供理论依据。
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[1] |
李庆达 贺园 贺宝荣. 骨质疏松性胸腰椎骨折椎体强化术后并发骨水泥渗漏的若干问题[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 193-197. |
[2] |
李云轩 舒钧 王志华 毕航川 郭立民 何绍烜 寇南楠 陈翰博. 特立帕肽治疗骨质疏松性椎体压缩骨折经皮椎体后凸成形术后残余腰背痛的效果[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 198-204. |
[3] |
高翔成 都金鹏 昌震 闫亮 吴佳源 赵志刚 高林 惠华 郝定均 贺宝荣. 骨质疏松性椎体压缩骨折椎体强化术后骨水泥移位的危险因素分析[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 205-212. |
[4] |
韩增帅 张益 丁磊 赵夏 崔茹婷 马温儒 张英泽 于腾波. 肩袖撕裂的相关危险因素分析及预测效能评估[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 213-219. |
[5] |
蓝文彬 林培森 王发圣 谢昀. 肘关节损伤三联征Adams分型中尺骨冠突骨折块形态学分析[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 220-226. |
[6] |
张炯豪 尹华伟 邱彦群 王海鹏 沈云东 徐文东. 腕关节镜辅助切开复位内固定治疗桡骨远端关节内骨折的疗效[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 227-233. |
[7] |
徐康帅 谷城 李嘉成 陈社强 陈煜辉 庄岩 侯志勇 樊仕才. 骶髂关节脱位合并同侧骶骨翼骨折分型的可信度检验及临床应用效果评价[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 234-239. |
[8] |
菅振 吕涛 敖荣广 王永安 姜新华 易诚青 禹宝庆. O形臂导航下通道螺钉治疗Ⅱ型老年脆性骨盆骨折的疗效[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 240-246. |
[9] |
高士基 刘宁 王续鹏. 关节镜下改良由外向内股骨骨道建立技术重建后交叉韧带的疗效[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 247-252. |
[10] |
何昌军 马腾 任程 李庆达 杨明义 熊晨 许毅博 李明 李忠 张堃. 股骨颈动力交叉钉系统与空心螺钉治疗中青年股骨颈骨折的疗效比较[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 253-259. |
[11] |
赵程程 刘玉飞 李赟 何毅 张协军 李维平. miR‑20b对重型创伤性脑损伤小鼠运动功能障碍的影响及其可能机制[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 260-267. |
[12] |
王健 陆芸 杨小锋. 中性粒细胞在组织修复中作用及机制的研究进展[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 268-273. |
[13] |
李豪 张飞 彭吾训. DNA甲基化调节间充质干细胞成骨分化调控创伤相关骨病的研究进展[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 274-282. |
[14] |
马娓 梁鑫 李佳鑫 敖圣翔 杨雪 唐婉琦 梁华平 杨霞. 高迁移率族蛋白1调控炎症反应机制的研究进展[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(3): 283-288. |
[15] |
弓伊宁 王江 贺宝荣. 骨质疏松性椎体骨折开放手术治疗的相关问题[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(2): 97-100. |
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