|
|
|
摘要 目的 通过对创伤性脑损伤（TBI）后脑组织的基因表达谱数据进行权重基因共表达网络分析（WGCNA），筛选具有重要意义的基因集，并明确其涉及的功能及信号通路，为TBI的机制研究和治疗提供参考。 方法 在基因表达数据库（GEO）中下载大鼠TBI基因表达谱数据GSE2871，将全部47个大鼠脑组织样本的8 799个基因的表达情况进行WGCNA分析；计算选择β加权软阈值后，对全部基因构建无向加权基因网络，识别具有高度绝对相关性的基因集；从数据库中获取样本信息并计算样本特征与模块间的相关性，选取与损伤程度及取样部位相关的模块进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析，从而获悉上述关键模块中基因涉及的生物学过程和通路；计算关键模块内基因的模块相关度和性状相关度，进而遴选关键模块中的核心基因。 结果 将GSE2871表达谱数据库中的所有大鼠脑组织样本和基因纳入WGCNA，共得出22个模块，分别标记为模块A~V。其中模块E、G、T、U与取样部位显著相关，模块E和模块G同时与损伤程度显著相关；GO分析和KEGG通路分析提示，与损伤程度和取样部位均显著相关的模块E、G中的基因主要参与白细胞迁移、细胞趋化及各种免疫反应调控等相关生物学过程，涉及抗原处理与呈递、细胞因子‑细胞因子受体相互作用及白细胞介素（IL）‑17信号等信号通路。与取样部位显著相关的模块T、U主要参与低氧反应、细胞代谢、细胞膜离子通道调控和信号传导等生物学过程，涉及神经退行性疾病信号通路、核糖体、自噬、神经活性的配体‑受体相互作用等信号通路；Tuba1b/1c、Ifitm3、Cebpd、Nfkbia、Serinc3、Pmpcb、Cyp4a8等为上述关键模块的核心基因。 结论 与大鼠TBI显著相关的基因主要参与免疫激活、炎症反应、能量代谢异常、钙离子通道失调、自噬异常及细胞凋亡等病理生理环节。
|
|
|
|
| [1] |
郑博隆 郝定均 贺宝荣. 《急性症状性骨质疏松性胸腰椎压缩骨折椎体强化术临床指南》要点解读[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 385-388. |
| [2] |
郭翔翔 王涛 马信龙 徐宝山 杨强 朱少文 李尚志 李路明. 经皮弯角椎体成形术与单侧经皮椎体后凸成形术治疗骨质疏松性椎体压缩骨折的疗效比较[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 389-395. |
| [3] |
张翼 寇红伟 尚国伟 姬彦辉 程田 陈向荣 包德明 郭俊杰 孔凡国 李玉伟 张成祺 朱卉敏 裴济民 王海蛟 刘宏建. 骨质疏松性椎体压缩骨折行经皮椎体成形术后骨水泥渗漏危险因素分析[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 396-400. |
| [4] |
余泽 蒋秋霞 董燕 郑曼丽 赖琛 孙建伟 杜宏艳 丁宇超 胡晓华. 常规治疗辅以长时程经颅直流电刺激对创伤性脑损伤后微意识状态患者意识恢复的作用[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 401-406. |
| [5] |
陈天喜 姜岱山 王伶俐 沈红五. 不同评分方法对急性创伤性脑损伤患者早期死亡风险的预测价值[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 407-412. |
| [6] |
陈善文 马更平 康全利. 5例钝性颈内动脉损伤致缺血性脑卒中的诊治方法[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 420-423. |
| [7] |
林需枰 刘庆军 丁真奇 林斌 林伟煌 谢玮娜 涂承权. 下胫腓螺钉固定联合下胫腓韧带修复治疗踝关节骨折合并下胫腓联合损伤的疗效[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 424-429. |
| [8] |
樊志强 张云飞 李萌 刘重 费晨 周凤金 邓洪利 王鹏飞 王虎 庄岩. 2015—2020年中国西部地区老年髋臼骨折患者流行病学特点[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 430-435. |
| [9] |
高宇澄 石柳 高旺 谢添 张曦文 刘敏 陈翔溆 张程 范文斌 崔学良 钱玉雷 李荥娟 陈辉 芮云峰. 老年髋部骨折患者术前低氧血症的危险因素分析[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 436-443. |
| [10] |
李勇奇 夏江 李兵 于涛 周海超 和文宝 李振东 俞光荣 杨云峰. 以后踝韧带结构及踝关节稳定性为基础的后踝骨折分型及其病理解剖学特征[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 444-451. |
| [11] |
程瑜 赵佳 冉娅莉 唐莹莹 罗柳 向彦岭. 6S结合PDCA循环精益化管理在创伤骨科手术护理管理中的应用[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 452-457. |
| [12] |
李颖 杨俊生 杨智伟 童梁成 赵磊 汪剑龄 孙中洋 薛庆. 小腿骨筋膜间隔综合征分级[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 458-461. |
| [13] |
李泽安 张晓红 别黎. 创伤性假性蛛网膜下腔出血的发病机制和诊治研究进展[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 462-466. |
| [14] |
靳贺 刘国栋. 胸部创伤评分研究进展[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 467-472. |
| [15] |
邵金鹏 符伟军. 膀胱战创伤的诊疗研究进展[J]. 中华创伤杂志, 2022, 38(5): 473-477. |
|
|
|
